Es la comisión que la entidad emisora de la tarjeta cobra a la red que ha instalado el terminal de punto de venta en un comercio. Al sacar efectivo de un cajero automático, quien paga la comisión de intercambio es la entidad emisora de la tarjeta a la red a la que pertenece el cajero, ya que en este caso es éste quien ofrece un servicio a aquél. Así, en este caso el sentido de la cesión es inverso.

Esta comisión en España es bastante alta en comparación con las de otros países de nuestro entorno. Hace años podían alcanzar porcentajes mayores incluso, aunque durante los últimos años se han mantenido entre el 0,6% y el 3%, según el tipo de comercio del que se tratase. Las comisiones de intercambio han sido la causa del enfrentamiento entre las entidades financieras y los comercios.

Éstos consideraban que si aquéllas se cobraran entre sí menos comisiones de intercambio, podrían cobrarles a los comercios menos comisiones de descuento. Realmente, como las redes de cajeros y terminales de punto de venta obtenían beneficios del margen entre ambos, quienes sufragaban los gastos eran los comerciantes, ya que veían cómo se les repercutía el coste de las comisiones de intercambio (sumándole un pequeño margen de beneficio para las redes propietarias de las terminales punto de venta). Bueno, realmente quien sufraga el coste de la red de terminales es el comprador final, usuario de tarjetas o no, porque el comerciante también repercute ese coste en el precio de sus productos. Y como no se van a poner unos precios para el pago con tarjeta y otros diferentes para el pago en efectivo, lo que se hace es ponerlos todos un poco más altos para compensar el coste de las tarifas de descuento.

La razón de que el cobro de la comisión de intercambio sea mayor o menor según el sector de actividad es que los bancos tienen ya estudiado qué sectores son más propicios para el fraude, y les cobran más comisión para compensar esta posibilidad.

En 2003, el partido socialista en la oposición pidió mediante una proposición de ley que las tres redes nacionales (Sistema 4B, Servired y Euro 6000) se unieran en una única compañía para posibilitar una bajada de las comisiones que se cobran a los comercios por los pagos efectuados con tarjeta. Era una propuesta un poco desesperada, que muestra lo difícil que iba a ser alcanzar un acuerdo.